MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020533	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020533	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020533	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020533	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020533	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020533	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020533	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020533	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020533	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020533	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
12	NC_020533	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194246
13	NC_020533	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194246
14	NC_020533	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194246
15	NC_020533	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
16	NC_020533	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194246
17	NC_020533	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194246
18	NC_020533	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194246
19	NC_020533	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	470194246
20	NC_020533	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194246
21	NC_020533	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
22	NC_020533	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	470194246
23	NC_020533	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	470194246
24	NC_020533	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194246
25	NC_020533	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194246
26	NC_020533	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
27	NC_020533	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
28	NC_020533	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194246
29	NC_020533	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
30	NC_020533	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194246
31	NC_020533	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
32	NC_020533	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194246
33	NC_020533	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194246
34	NC_020533	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
35	NC_020533	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
36	NC_020533	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194246
37	NC_020533	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	470194246
38	NC_020533	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470194246
39	NC_020533	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
40	NC_020533	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194246
41	NC_020533	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	470194246
42	NC_020533	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	470194246
43	NC_020533	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	470194246
44	NC_020533	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
45	NC_020533	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194246
46	NC_020533	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	470194246
47	NC_020533	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	470194246
48	NC_020533	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
49	NC_020533	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
50	NC_020533	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020533	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020533	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020533	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020533	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020533	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020533	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020533	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020533	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020533	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
60	NC_020533	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
61	NC_020533	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
62	NC_020533	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194247
63	NC_020533	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
64	NC_020533	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194247
65	NC_020533	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	470194247
66	NC_020533	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
67	NC_020533	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470194247
68	NC_020533	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
69	NC_020533	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470194247
70	NC_020533	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	470194247
71	NC_020533	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194247
72	NC_020533	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194247
73	NC_020533	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	470194247
74	NC_020533	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194247
75	NC_020533	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194247
76	NC_020533	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	470194247
77	NC_020533	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
78	NC_020533	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194247
79	NC_020533	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470194247
80	NC_020533	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
81	NC_020533	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194247
82	NC_020533	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
83	NC_020533	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
84	NC_020533	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194247
85	NC_020533	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194247
86	NC_020533	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194247
87	NC_020533	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194247
88	NC_020533	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	470194247
89	NC_020533	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
90	NC_020533	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	470194247
91	NC_020533	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
92	NC_020533	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
93	NC_020533	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194247
94	NC_020533	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194247
95	NC_020533	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
96	NC_020533	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020533	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020533	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020533	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020533	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020533	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020533	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020533	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020533	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020533	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020533	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020533	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020533	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020533	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020533	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020533	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020533	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020533	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020533	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020533	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020533	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020533	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194248
118	NC_020533	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	470194248
119	NC_020533	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194248
120	NC_020533	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	470194248
121	NC_020533	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194248
122	NC_020533	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470194248
123	NC_020533	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194248
124	NC_020533	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194248
125	NC_020533	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194248
126	NC_020533	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	470194248
127	NC_020533	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194248
128	NC_020533	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194248
129	NC_020533	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194248
130	NC_020533	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194248
131	NC_020533	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194248
132	NC_020533	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194248
133	NC_020533	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194248
134	NC_020533	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194248
135	NC_020533	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194248
136	NC_020533	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194249
137	NC_020533	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	470194249
138	NC_020533	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	470194249
139	NC_020533	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194249
140	NC_020533	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194249
141	NC_020533	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	470194249
142	NC_020533	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194249
143	NC_020533	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194249
144	NC_020533	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194249
145	NC_020533	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194249
146	NC_020533	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	470194249
147	NC_020533	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194249
148	NC_020533	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	470194249
149	NC_020533	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
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151	NC_020533	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	470194249
152	NC_020533	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194249
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155	NC_020533	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194249
156	NC_020533	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194249
157	NC_020533	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194249
158	NC_020533	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
159	NC_020533	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	470194249
160	NC_020533	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
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162	NC_020533	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194249
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164	NC_020533	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	470194249
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167	NC_020533	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	470194249
168	NC_020533	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	470194249
169	NC_020533	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	470194249
170	NC_020533	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
171	NC_020533	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194249
172	NC_020533	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
173	NC_020533	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470194249
174	NC_020533	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	470194249
175	NC_020533	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194249
176	NC_020533	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
177	NC_020533	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_020533	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020533	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	470194250
180	NC_020533	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194250
181	NC_020533	A	6	6	7197	7202	100 %	0 %	0 %	0 %	470194250
182	NC_020533	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194250
183	NC_020533	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194250
184	NC_020533	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	470194250
185	NC_020533	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194250
186	NC_020533	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194250
187	NC_020533	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
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189	NC_020533	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	470194250
190	NC_020533	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194250
191	NC_020533	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	470194250
192	NC_020533	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194250
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194	NC_020533	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470194250
195	NC_020533	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194250
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210	NC_020533	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194250
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213	NC_020533	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
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220	NC_020533	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194250
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244	NC_020533	AAC	3	9	9505	9513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194250
245	NC_020533	ATG	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
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247	NC_020533	AGA	2	6	9575	9580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194250
248	NC_020533	ATG	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
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250	NC_020533	ACA	2	6	9644	9649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194250
251	NC_020533	ATC	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194250
252	NC_020533	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194250
253	NC_020533	AAT	2	6	9670	9675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194250
254	NC_020533	A	7	7	9676	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020533	TGG	2	6	9813	9818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194251
256	NC_020533	CATA	2	8	9824	9831	50 %	25 %	0 %	25 %	470194251
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258	NC_020533	ACC	2	6	9951	9956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194251
259	NC_020533	T	6	6	10026	10031	0 %	100 %	0 %	0 %	470194251
260	NC_020533	ACA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194251
261	NC_020533	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470194251
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264	NC_020533	GTCA	2	8	10305	10312	25 %	25 %	25 %	25 %	470194251
265	NC_020533	TTG	2	6	10397	10402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194251
266	NC_020533	CAC	2	6	10469	10474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194251
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268	NC_020533	TAA	2	6	10497	10502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194251
269	NC_020533	TCT	2	6	10531	10536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194251
270	NC_020533	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020533	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020533	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_020533	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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